Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Letm2Q7TNU7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Letm2Q7TNU7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Letm2Q7TNU7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Letm2Q7TNU7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Letm2Q7TNU7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Letm2Q7TNU7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Letm2Q7TNU7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Letm2Q7TNU7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Letm2Q7TNU7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Letm2Q7TNU7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Letm2Q7TNU7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms