Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim46Q7TNM2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim46Q7TNM2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim46Q7TNM2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim46Q7TNM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms