Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nphp3Q7TNH6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nphp3Q7TNH6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nphp3Q7TNH6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nphp3Q7TNH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms