Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SugctQ7TNE1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SugctQ7TNE1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SugctQ7TNE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms