Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn4bQ7M729 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn4bQ7M729 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn4bQ7M729 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn4bQ7M729 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn4bQ7M729 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn4bQ7M729 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn4bQ7M729 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn4bQ7M729 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn4bQ7M729 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn4bQ7M729 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms