Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox11Q7M6Y2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox11Q7M6Y2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox11Q7M6Y2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox11Q7M6Y2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms