Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim12Q78RX3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim12Q78RX3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smim12Q78RX3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smim12Q78RX3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim12Q78RX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms