Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Eci3Q78JN3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Eci3Q78JN3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Eci3Q78JN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eci3Q78JN3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms