Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Higd1cQ76I25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Higd1cQ76I25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms