Protein–RNA interactions for Protein: Q71FD5

Znrf2, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf2Q71FD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znrf2Q71FD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrf2Q71FD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrf2Q71FD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrf2Q71FD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms