Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
March6Q6ZQ89 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
March6Q6ZQ89 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
March6Q6ZQ89 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
March6Q6ZQ89 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
March6Q6ZQ89 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms