Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cand1Q6ZQ38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cand1Q6ZQ38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cand1Q6ZQ38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cand1Q6ZQ38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cand1Q6ZQ38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cand1Q6ZQ38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cand1Q6ZQ38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cand1Q6ZQ38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms