Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Kdm3bQ6ZPY7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34,37■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34,34■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34,34■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Kdm3bQ6ZPY7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34,22■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm3bQ6ZPY7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Kdm3bQ6ZPY7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms