Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssx9Q6XAS3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssx9Q6XAS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ssx9Q6XAS3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssx9Q6XAS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssx9Q6XAS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms