Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Asic3Q6X1Y6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Asic3Q6X1Y6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asic3Q6X1Y6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Asic3Q6X1Y6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asic3Q6X1Y6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Asic3Q6X1Y6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Asic3Q6X1Y6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Asic3Q6X1Y6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms