Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hsh2dQ6VYH9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hsh2dQ6VYH9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hsh2dQ6VYH9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hsh2dQ6VYH9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms