Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhbdf1Q6PIX5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdf1Q6PIX5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms