Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a2Q6PIE5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a2Q6PIE5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1a2Q6PIE5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a2Q6PIE5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms