Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx13Q6PHS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx13Q6PHS6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms