Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmeff1Q6PFE7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmeff1Q6PFE7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmeff1Q6PFE7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmeff1Q6PFE7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmeff1Q6PFE7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmeff1Q6PFE7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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