Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sarm1Q6PDS3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sarm1Q6PDS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sarm1Q6PDS3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms