Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim37Q6PCX9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim37Q6PCX9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim37Q6PCX9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim37Q6PCX9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim37Q6PCX9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms