Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp12Q6P5B0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp12Q6P5B0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp12Q6P5B0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rrp12Q6P5B0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rrp12Q6P5B0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrp12Q6P5B0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rrp12Q6P5B0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp12Q6P5B0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms