Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Soga3Q6NZL0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Soga3Q6NZL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Soga3Q6NZL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Soga3Q6NZL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms