Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZH9

Rasgrp3, RAS, guanyl-releasing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp3Q6NZH9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasgrp3Q6NZH9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasgrp3Q6NZH9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rasgrp3Q6NZH9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrp3Q6NZH9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrp3Q6NZH9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms