Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Szrd1Q6NXN1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Szrd1Q6NXN1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Szrd1Q6NXN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms