Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retreg2Q6NS82 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retreg2Q6NS82 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retreg2Q6NS82 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg2Q6NS82 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms