Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt87Q6IMF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt87Q6IMF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt87Q6IMF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt87Q6IMF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Krt87Q6IMF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt87Q6IMF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms