Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt39Q6IFX4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt39Q6IFX4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt39Q6IFX4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt39Q6IFX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms