Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Best3Q6H1V1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Best3Q6H1V1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Best3Q6H1V1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Best3Q6H1V1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Best3Q6H1V1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Best3Q6H1V1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Best3Q6H1V1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Best3Q6H1V1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms