Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scaf8Q6DID3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Scaf8Q6DID3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scaf8Q6DID3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf8Q6DID3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms