Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep290Q6A078 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep290Q6A078 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep290Q6A078 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep290Q6A078 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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