Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4bp1Q6A037 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
N4bp1Q6A037 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
N4bp1Q6A037 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
N4bp1Q6A037 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
N4bp1Q6A037 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
N4bp1Q6A037 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms