Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msl2Q69ZF8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msl2Q69ZF8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msl2Q69ZF8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms