Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Sptbn2Q68FG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sptbn2Q68FG2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptbn2Q68FG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sptbn2Q68FG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.7 ms