Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sdc3Q64519 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdc3Q64519 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc3Q64519 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc3Q64519 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms