Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gja3Q64448 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gja3Q64448 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gja3Q64448 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gja3Q64448 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gja3Q64448 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gja3Q64448 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gja3Q64448 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gja3Q64448 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gja3Q64448 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gja3Q64448 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gja3Q64448 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja3Q64448 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja3Q64448 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja3Q64448 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja3Q64448 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja3Q64448 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja3Q64448 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja3Q64448 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gja3Q64448 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms