Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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