Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccpg1Q640L3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccpg1Q640L3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccpg1Q640L3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccpg1Q640L3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms