Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vat1Q62465 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vat1Q62465 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vat1Q62465 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.8 ms