Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20854Q62461 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20854Q62461 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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