Protein–RNA interactions for Protein: Q62419

Sh3gl1, Endophilin-A2, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl1Q62419 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3gl1Q62419 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sh3gl1Q62419 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl1Q62419 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl1Q62419 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms