Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sorbs1Q62417 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sorbs1Q62417 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sorbs1Q62417 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorbs1Q62417 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sorbs1Q62417 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms