Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sycp1Q62209 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp1Q62209 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sycp1Q62209 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sycp1Q62209 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sycp1Q62209 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms