Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx3xQ62167 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx3xQ62167 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx3xQ62167 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx3xQ62167 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx3xQ62167 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms