Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sin3bQ62141 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sin3bQ62141 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sin3bQ62141 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sin3bQ62141 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3bQ62141 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms