Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msi1Q61474 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msi1Q61474 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msi1Q61474 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msi1Q61474 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msi1Q61474 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msi1Q61474 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms