Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pde3bQ61409 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pde3bQ61409 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde3bQ61409 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms