Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lamb3Q61087 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lamb3Q61087 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamb3Q61087 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms