Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfrsf8Q60846 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf8Q60846 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf8Q60846 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms